他想善良的牧者应与自己的羊群同呼吸共命运，不能躲避，于是，他决定回汉阳，3月12日到政府自首。5月31日在沙南基首刑为主致命，年仅50岁。

（参出22：4，7）如果自首自愿赔偿损失，则只需归还失物原来价值，另加五分之一。（参肋6：5；民5：7）这个平日的掠夺者，怎么会转身下树就改弦易辙，决意重罚自己，成了个散财济贫的义人呢？！

一位男生前来自首：老师，那一次你粉笔盒里的小青蛙其实是我放的，你错怪了小其。爱调皮捣蛋的小其在一旁乐得直拍手：老师我要平反。耶稣说，不要判断人，免得受判断。看来我犯错了，抱歉抱歉！

更为严重的是，参与机要工作的朱淇为其兄所迫，向清廷自首，泄露了起义的秘密。于是广东地方官吏加强戒备，孙中山一到广州就受到监视及搜捕，被迫四处藏匿。

在武汉他被指控扔砖头伤人，因为不信任当地警方，自己花1000多块钱坐飞机到北京朝阳双井派出所自首。